La sfârșitul anilor 1940, Robert B. și Alice P. Withrow, care lucrează la Universitatea Purdue, au dezvoltat o metodă hidroponică practică. Sistemul lor hidroponic a inundat și drenat alternativ un recipient care conținea pietriș și rădăcinile plantelor. Acest lucru a oferit plantelor cantitatea optimă atât de soluție nutritivă, cât și de aer pentru a facilita o creștere rapidă și eficientă.
În timpul celui de-al Doilea Război Mondial, transportul de legume proaspete peste ocean nu a fost practic, iar insulele îndepărtate în care erau staționate trupele nu erau un loc în care să poată fi cultivate în sol. Tehnologia hidroponică a fost testată ca o sursă viabilă pentru legume proaspete în această perioadă.
În 1945, Forțele Aeriene ale SUA au construit una dintre primele ferme hidroponice mari pe Insula Ascension din Atlanticul de Sud, urmate de ferme hidroponice suplimentare pe insulele Iwo Jima și Okinawa din Pacific, folosind roca vulcanică zdrobită ca mediu de creștere și, pe Insula Wake, la vest de Hawaii, folosind pietriș ca mediu de creștere. Aceste ferme hidroponice au contribuit la satisfacerea nevoii de aprovizionare cu legume proaspete pentru trupele staționate în aceste zone.
În acest timp, au fost înființate mari instalații hidroponice în Habbaniya, Irak și Bahrain în Golful Persic, pentru a sprijini trupele staționate în acele zone din apropierea unor mari rezerve de petrol.
Armata americană și Royal Air Force au construit unități hidroponice la diferite baze militare pentru a ajuta la hrănirea trupelor. În 1952, ramura specială hidroponică a armatei SUA a crescut peste 8.000.000 de lbs. de produse proaspete pentru cererea militară. De asemenea, în acest moment a fost înființată una dintre cele mai mari ferme hidroponice din lume în Chofu, Japonia, formată din 22 de hectare.
În urma succesului hidroponiei în al Doilea Război Mondial, în SUA au fost construite mai multe ferme hidroponice comerciale mari, majoritatea fiind în Florida. Cu toate acestea, din cauza construcției și managementului slab, multe dintre aceste ferme nu au avut succes. Chiar dacă potențialul hidroponiei era incredibil, hidroponia comercială din SUA a fost oprită până când sistemele hidroponice care erau economice de construit și relativ ușor de operat, au devenit disponibile pe piață.